O-ftalaldehidoa bitarteko farmazeutikoa da, desinfektatzaile topiko seguru eta eraginkorra, ospitaleetako kirurgia endoskopikoko tresna esterilizazio gisa, Bofen indolaren plaketen agregazioaren aurkako droga berria sintetizatzeko, baina baita erreaktibo analitiko kimikoaren eremua ere. O-ftalaldehidoa medikuntzan erabiltzen da batez ere. , koloratzaileak, etab. Aminoazidoen deribatizazio erreaktiboa, fluoreszentzia hautematea, minutu bateko erreakzioa, baina produktua ez da egonkorra, berehala detektatu behar dute.